Podczas gdy poprzednie generacje korzystały z wentylatora wlotowego po jednej stronie, nadmuchującego płytkę drukowaną, a drugi wentylator na tylnym końcu płyty tylnej wyciągał powietrze przez radiator i na zewnątrz, RTX 5090 FE ma dwa duże wentylatory, z których oba dmuchają na zimno powietrze przez radiator i na zewnątrz karty. Płytka drukowana znajduje się pośrodku karty i opiera się na zestawie płytek PCB umożliwiających interfejs hosta i wyjścia wyświetlacza.
Największym elementem PCB, zajmującym niemal 1/3 powierzchni płytki, jest procesor graficzny „GB202”, na którym oparty jest RTX 5090. Procesor graficzny ma gigantyczną liczbę pinów nie tylko ze względu na zapotrzebowanie na energię, ale także ze względu na 512-bitowy interfejs pamięci GDDR7. W jednym rogu płytki drukowanej, wystającym z górnej części chłodnicy, znajduje się wejście zasilania karty 12V2x6, które ma moc znamionową 600 W (nie znamy jeszcze TGP RTX 5090).
Karta wykorzystuje rozwiązanie VRM z 19 fazami dla VGPU i 8 fazami dla pamięci. Podobnie jak w przypadku płyt GPU AI, NVIDIA zastosowała technologię PCB o dużej gęstości, nie marnując miejsca po obu stronach płytki PCB. Dławiki i DRMOS (wyprodukowane przez MPS) znajdują się na awersie i otaczają GPU z trzech stron; a kondensatory są po drugiej stronie.
Na odwrotnej stronie płytki drukowanej znajdują się złącza prowadzące do dwóch elementów rozłączanych. Pierwszy podłącza się do płytki PCB za pomocą złotych palców PCI-Express 5.0 x16. Drugie złącze prowadzi do rozłączenia wejść/wyjść wyświetlacza. Obydwa połączenia wykonano za pomocą cienkich kabli taśmowych, takich jak te w laptopach, i poprowadzono wzdłuż krawędzi chłodnicy, tak aby nie utrudniać przepływu powietrza.